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仅使用蛋白质组学对多克隆抗体进行测序

放大字体  缩小字体 来源:作者 2024-05-09 04:10  浏览次数:91 来源:http://www.cizai.com.cn/    

热点;nsored有限公司内容由Rapid Novor Inc .提供思想领袖澳门斌-快速Novor公司创始人兼总裁

在本次采访中,News-Medical采访了Rapid Novor总裁马斌,介绍了他们仅使用蛋白质组学对多克隆抗体进行测序的最新研究。

我的名字叫马斌。我是Rapid Novor的联合创始人兼总裁。我们在Rapid Novor的团队在生物信息学和基于质谱的蛋白质组学研究和开发方面拥有20多年的经验。

我们的单克隆抗体(mAb)蛋白质测序技术已经成功解码了来自全球机构的3000多个抗体和蛋白质序列,包括顶级制药公司和学术机构。

正是这个坚实的基础巩固了我们作为行业颠覆者的地位。由于首先引入了WILD?(w离子异亮氨酸-亮氨酸测定),我们是第一个常规、全面、准确地对单克隆抗体进行测序的公司,现在我们是第一个对多克隆抗体混合物进行抗体测序的公司,而不依赖于核苷酸测序数据。

图片来源:Rapid Novor

我们的突破使科学家能够直接利用动物血液中自然发生的、与生物相关的抗体循环池。与其他竞争技术相比,我们的REpAb?抗体发现方法的周转时间要快得多,我们也能找到更多有效的互补抗体。

现有的抗体发现平台通常要求抗体蛋白或等效的b细胞受体(BCR)在产生抗体的细胞表面表达。然后根据抗体或BCR对抗原的亲和力选择细胞。细胞选择后,对细胞内的DNA或RNA进行测序。这就要求在抗体发现过程的任何时候都要将基因和蛋白质联系起来,严重限制了筛选的选择。能够直接对蛋白质进行测序意味着人们第一次可以打破基因-蛋白质的联系,而只需要操纵相关的抗体蛋白质分子。

我们的REpAb?抗体发现平台结合了我们从头开始的蛋白质测序技术和蛋白质化学的新专利进展。我们专有的生物信息学算法和基于质谱的蛋白质组学实验室的无缝集成使我们能够推进迄今为止的蛋白质测序技术。

工作流程从pAb样本开始,或免疫后的出血样本。从那里开始,样品被亲和纯化,消化,并通过液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)运行。结果数据用我们专有的de novo蛋白质测序和生物信息学软件进行分析,并由蛋白质组学专家进行评估。全长抗体序列包括配对的重-轻链,用于随后的重组表达和测试。

虽然这两种抗体都是由免疫动物产生的,但单克隆抗体通常更容易产生,并且比单克隆抗体具有更好的活性。然而,pAb存在批次间的可变性,这使得它们不适合许多重要的应用,如抗体药物和体外诊断。我们的技术可用于从单抗样品中获得许多单抗序列。

然后,序列信息可用于生产重组单抗(rAbs)的混合物,该混合物具有单抗的能力和单抗的可重复性。目前发现治疗性和诊断性抗体的方法并不直接针对抗体蛋白,因此受到限制,因为它们可能无法捕获功能重要的抗体库。

我们的技术提供了一个强大的,更短的途径来获取关键抗体,并通过提高其可重复性,为从事pAb诊断的科学家提供了安心。

原因很简单:细胞比蛋白质更难接近。例如,我们的一些客户使用杂交瘤来生产单克隆抗体,不幸的是由于存储问题(例如,停电)而失去了细胞系。它们通常仍然有少量的抗体蛋白质,我们可以对它们进行测序,以“恢复”它们的抗体。

再举一个例子,在动物免疫后的抗体发现中,抗原特异性抗体蛋白在血液中循环,而产生这些抗体的细胞驻留在组织和脾脏中,但很少或根本没有在血液中循环。获取血液比提取细胞要容易得多,特别是当直接从人体中发现抗体时。

第三个例子,在一种叫做多发性骨髓瘤的血癌中,癌细胞驻留在骨髓中,很少甚至没有在血液中循环。然而,它们大量产生一种在血液中循环的抗体蛋白。我们仅使用蛋白质组学进行测序的能力使我们能够开发一种非侵入性血液检测方法,用于监测多发性骨髓瘤,其灵敏度与侵入性骨髓检测方法一样高。

自身免疫性疾病。图片来源:nelzajamal/Shutterstock.com

可能性是无限的。首先,我们的技术可以帮助从免疫动物或人类患者的血液中发现新的抗体药物。从人类血液中发现的抗体特别有趣,因为这些人类抗体在临床使用时不太可能具有免疫原性,因此增加了药物抗体药物的安全性和成功率。

但更重要的是,在癌症、疫苗反应和自身免疫性疾病中,我们的免疫系统会产生针对特定抗原的抗体。对这些循环抗体进行测序,揭示了我们免疫系统的重要信息,使研究人员能够诊断疾病或协助治疗,就像免疫疗法已经完成的那样。

我预计未来的治疗将越来越依赖于帮助我们的免疫系统对抗疾病。我们的抗体测序技术,经过进一步的发展,将能够提供体液免疫反应的完整概况,这将有助于临床医生在他们的治疗决策过程中。

事实上,我们目前正在使用我们的测序技术提供一种非侵入性、敏感和准确的检测方法EasyM?,用于追踪血癌多发性骨髓瘤。

我预计,高通量从头开始的蛋白质测序技术将产生与高通量DNA测序对生命科学行业一样大的影响。DNA和蛋白质都是生命的重要分子。与DNA相比,蛋白质与疾病更直接相关,并且还包含DNA所不包含的信息,例如翻译后修饰。

直接靶向蛋白质也可以让临床医生量化疾病状态。这两种特性使蛋白质成为理想的生物标志物。抗体是一类特别重要的蛋白质,因为它们的结合特性使它们非常适合对抗疾病。由于它们也大量存在于外周血中,因此对它们进行测序将有助于推进治疗和生物标志物的发现。

原因有很多。首先,我们汇集了世界一流的多学科团队,致力于推进从头开始的蛋白质测序技术。我们的使命是继续引领下一代蛋白质测序。其次,我们在所有学科都有广泛的专业知识,使从头开始的蛋白质测序成为可能。

例如,自2000年以来,我一直在进行基于质谱法的从头测序研究,当时质谱法刚刚成为蛋白质组学的强大工具。从那时起,我开发了在学术界和工业界广泛使用的从头测序软件。第三,我们在单抗测序服务上的初步商业成功使我们接触到了大量具有挑战性的抗体样本。

通过解决这些具有挑战性的样本,我们积累了越来越多的专业知识,我们利用这些知识通过新的算法和机器学习进一步改进我们的计算机软件。

用质谱法登陆月球:Polyclo 带0的nal测序 原来蛋白质组学

内部专业知识和最先进的软件的结合使我们成为蛋白质测序技术的先锋。我们在算法开发方面有超过20年的经验,已经在3000多个蛋白质测序项目中得到了利用。

许多科学家从我们的技术中受益,他们获得了专利数据,推进了他们的研发,并表征了蛋白质治疗方法,最近仅使用蛋白质组学就从富含bab的样品中获得了序列。

我们的客户选择我们是因为我们是我们领域的领导者,但也因为我们的客户服务。我们的科学销售主管为世界各地的客户提供全天候的服务。因为我们的科学销售主管是科学家,他们有了解和授权客户正确的抗体蛋白测序方法的背景,以补充他们的管道。他们的可靠和平易近人的态度为我们赢得了友好的服务和值得信赖的声誉。

我们将探索我们的测序技术的不同应用。蛋白质从头测序是一项前所未有的新技术。在我们的早期,我们不得不花费大量的精力来教育市场,让潜在的客户知道这项技术的可用性。通过这个过程,越来越多的人意识到这项技术。

与此同时,我们也发现了同样的测序技术的新应用。除了我们之前讨论的应用之外,我预见科学家们将继续在他们的特定应用中使用这项技术,甚至找到在未来应用中利用其有用性的新方法。我们将与全球客户合作,满足他们对下一代蛋白质测序技术日益增长的需求。

图片来源:Rapid Novor

我坚信,每一批抗体都需要进行测序,以确保其质量和可重复性。通过我们的抗体测序技术,我认为Rapid Novor将成为抗体生产和治疗领域可重复性的关键供应商。此外,通过常规检测和监测人体血液中的抗体,可以实现正在进行的和潜在的疾病管理。

作为全球最大和领先的从头抗体蛋白测序公司,Rapid Novor将满足个性化医疗保健的需求,我们预计每年将有数十万个测序任务的需求。此外,作为抗体治疗和诊断质量控制的一部分,我预计每年或几年后将需要数十万个测序任务。通过我们在下一代蛋白质测序方面的持续领导地位,Rapid Novor将为整个生命科学行业的科学家提供他们可以信赖的序列。

我们的技术在过去经常被用于验证抗体序列,作为治疗和诊断开发质量控制过程的一部分。考虑到这一需求,我们创建了MATCHmAbTM作为一项服务,目前我们正在与现有的客户群进行试验。MATCHmAbTM对依赖其产品可重复性的试剂制造商和抗体试剂用户特别有意义。有了MATCHmAbTM,他们可以放心,他们生产或使用的抗体日复一日、年复一年都是一样的。我们欢迎科学家与我们联系,询问有关这项新服务的更多信息。

我们还将在临床环境中应用我们的测序平台。作为我们改善人类健康承诺的一部分,我们已经利用我们的蛋白质测序技术,通过跟踪m蛋白生物标志物来监测多发性骨髓瘤的复发,并进行了两项临床试验,迄今为止取得了良好的结果。我们的多克隆测序技术将有助于推进我们目前在这方面的努力。

最后,另一个利用我们的测序技术的平台也将受益于我们在这里讨论的蛋白质组学突破,这是我们的NovorIgTM平台,它可以量化免疫反应。这个平台对于疫苗学研究,甚至监测自身免疫非常有用。

我们的网站www.rapidnovor.com为有兴趣了解蛋白质测序如何有益于他们的研究的学术界和工业界科学家提供了大量信息。我们还推荐以下文章:《深入研究免疫》和《多克隆抗体测序用于新一代抗体发现》。

Rapid Novor公司是世界领先的抗体蛋白测序公司,也是加拿大最大的私人资助质谱蛋白质组学设施的所在地。Rapid Novor的团队继续通过其行业领先的REmAb?平台推动蛋白质测序的界限,现在其突破性的REpAb?抗体发现平台,两者都可以直接测序抗体蛋白而无需进入细胞系。

该团队在蛋白质组学,生物信息学和大数据处理方面拥有超过20年的专业经验,并且是第一个提供区分异亮氨酸和亮氨酸(WILD?)的商业解决方案的团队。Rapid Novor致力于通过下一代蛋白质测序来推进生命科学,以改善人类健康。

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